Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk4P30285 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk4P30285 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk4P30285 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk4P30285 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk4P30285 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms