Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd3P30282 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd3P30282 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd3P30282 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms