Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb3P28231 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb3P28231 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms