Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CenpbP27790 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpbP27790 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CenpbP27790 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpbP27790 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms