Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CftrP26361 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CftrP26361 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CftrP26361 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CftrP26361 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CftrP26361 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CftrP26361 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CftrP26361 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CftrP26361 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CftrP26361 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CftrP26361 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CftrP26361 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CftrP26361 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CftrP26361 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CftrP26361 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CftrP26361 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CftrP26361 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CftrP26361 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CftrP26361 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CftrP26361 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CftrP26361 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CftrP26361 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CftrP26361 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CftrP26361 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CftrP26361 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CftrP26361 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CftrP26361 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CftrP26361 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CftrP26361 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CftrP26361 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CftrP26361 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CftrP26361 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CftrP26361 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CftrP26361 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CftrP26361 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CftrP26361 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CftrP26361 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CftrP26361 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CftrP26361 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CftrP26361 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CftrP26361 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CftrP26361 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CftrP26361 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CftrP26361 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CftrP26361 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CftrP26361 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CftrP26361 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CftrP26361 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CftrP26361 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CftrP26361 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CftrP26361 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CftrP26361 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CftrP26361 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CftrP26361 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CftrP26361 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CftrP26361 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CftrP26361 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CftrP26361 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CftrP26361 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CftrP26361 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CftrP26361 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CftrP26361 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CftrP26361 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CftrP26361 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CftrP26361 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CftrP26361 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CftrP26361 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CftrP26361 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CftrP26361 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CftrP26361 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CftrP26361 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CftrP26361 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CftrP26361 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CftrP26361 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CftrP26361 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CftrP26361 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CftrP26361 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms