Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh1a1P24549 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh1a1P24549 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms