Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd12P23812 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd12P23812 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
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