Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf8P23611 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf8P23611 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf8P23611 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf8P23611 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf8P23611 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms