Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkchP23298 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkchP23298 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkchP23298 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkchP23298 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkchP23298 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkchP23298 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkchP23298 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkchP23298 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkchP23298 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkchP23298 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkchP23298 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkchP23298 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkchP23298 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkchP23298 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkchP23298 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkchP23298 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkchP23298 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms