Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms