Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfaP20033 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms