Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a1P19437 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms