Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RargP18911 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RargP18911 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RargP18911 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RargP18911 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RargP18911 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RargP18911 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RargP18911 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RargP18911 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RargP18911 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RargP18911 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RargP18911 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RargP18911 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RargP18911 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RargP18911 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RargP18911 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RargP18911 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RargP18911 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RargP18911 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RargP18911 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RargP18911 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RargP18911 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RargP18911 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RargP18911 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms