Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18530 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18530 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18530 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18530 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18530 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18530 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P18530 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18530 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18530 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms