Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cxcl9P18340 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms