Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptbp1P17225 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms