Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna1P16388 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms