Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rag1P15919 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rag1P15919 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rag1P15919 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms