Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmnb1P14733 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lmnb1P14733 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lmnb1P14733 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmnb1P14733 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb1P14733 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmnb1P14733 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmnb1P14733 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmnb1P14733 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmnb1P14733 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmnb1P14733 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms