Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms