Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcp1P11983 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcp1P11983 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcp1P11983 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcp1P11983 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms