Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OtcP11725 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtcP11725 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtcP11725 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OtcP11725 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtcP11725 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtcP11725 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtcP11725 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtcP11725 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtcP11725 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtcP11725 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtcP11725 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtcP11725 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtcP11725 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtcP11725 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtcP11725 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtcP11725 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtcP11725 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtcP11725 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtcP11725 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OtcP11725 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtcP11725 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtcP11725 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtcP11725 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtcP11725 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtcP11725 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OtcP11725 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OtcP11725 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OtcP11725 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OtcP11725 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtcP11725 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtcP11725 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtcP11725 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms