Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamp1P11438 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamp1P11438 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamp1P11438 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms