Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaraP11416 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaraP11416 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaraP11416 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaraP11416 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaraP11416 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RaraP11416 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RaraP11416 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RaraP11416 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaraP11416 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaraP11416 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaraP11416 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaraP11416 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaraP11416 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaraP11416 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaraP11416 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaraP11416 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaraP11416 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaraP11416 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RaraP11416 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaraP11416 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RaraP11416 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaraP11416 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaraP11416 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaraP11416 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaraP11416 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaraP11416 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaraP11416 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaraP11416 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms