Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd8bP10300 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd8bP10300 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms