Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem254aP0DN89 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms