Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6c1P0CW02 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms