Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3P09920 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3P09920 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms