Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1P09055 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms