Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgk2P09041 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgk2P09041 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgk2P09041 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms