Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApoeP08226 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ApoeP08226 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ApoeP08226 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms