Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CfhP06909 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CfhP06909 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CfhP06909 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CfhP06909 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CfhP06909 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CfhP06909 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CfhP06909 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CfhP06909 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CfhP06909 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CfhP06909 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CfhP06909 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CfhP06909 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CfhP06909 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CfhP06909 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CfhP06909 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CfhP06909 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CfhP06909 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CfhP06909 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CfhP06909 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CfhP06909 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CfhP06909 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CfhP06909 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CfhP06909 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CfhP06909 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CfhP06909 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CfhP06909 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CfhP06909 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CfhP06909 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CfhP06909 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CfhP06909 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CfhP06909 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CfhP06909 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CfhP06909 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CfhP06909 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CfhP06909 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CfhP06909 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CfhP06909 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CfhP06909 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CfhP06909 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CfhP06909 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CfhP06909 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms