Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd3dP04235 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms