Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04214 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04214 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04214 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04214 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04214 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04214 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P04214 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04214 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04214 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04214 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04214 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04214 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04214 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04214 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04214 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P04214 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04214 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04214 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04214 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04214 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04214 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
P04214 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P04214 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P04214 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04214 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04214 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04214 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04214 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04214 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04214 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04214 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04214 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms