Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04212 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04212 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04212 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04212 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04212 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04212 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04212 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04212 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P04212 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms