Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GzmbP04187 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GzmbP04187 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms