Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tk1P04184 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tk1P04184 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tk1P04184 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tk1P04184 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms