Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01822 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01822 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01822 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01822 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01822 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01822 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01822 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01822 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01822 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01822 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01822 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01822 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01822 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01822 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01822 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01822 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01822 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01822 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms