Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01792 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01792 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01792 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01792 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01792 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01792 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01792 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01792 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01792 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01792 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01792 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01792 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01792 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01792 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01792 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01792 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01792 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01792 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01792 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01792 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01792 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01792 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms