Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01790 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01790 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01790 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01790 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01790 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01790 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01790 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01790 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01790 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01790 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01790 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01790 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01790 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01790 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01790 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01790 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01790 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01790 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01790 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01790 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01790 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01790 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01790 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01790 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01790 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01790 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms