Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01740 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01740 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01740 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01740 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01740 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01740 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01740 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01740 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01740 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01740 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01740 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P01740 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01740 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01740 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01740 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01740 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms