Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01659 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01659 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01659 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01659 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01659 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01659 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01659 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01659 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01659 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01659 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01659 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01659 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01659 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01659 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01659 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01659 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01659 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01659 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms