Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01646 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P01646 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01646 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01646 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01646 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01646 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01646 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01646 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01646 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01646 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P01646 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01646 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01646 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01646 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01646 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01646 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01646 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01646 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01646 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
P01646 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01646 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01646 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01646 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01646 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01646 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01646 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01646 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01646 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01646 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01646 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms