Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01641 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01641 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01641 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01641 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01641 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01641 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01641 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01641 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P01641 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01641 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01641 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01641 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01641 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01641 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01641 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P01641 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01641 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01641 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01641 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms