Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifna1P01572 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna1P01572 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms