Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1aO89116 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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