Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc6O88978 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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