Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gnpda1O88958 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gnpda1O88958 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms