Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MscO88940 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MscO88940 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MscO88940 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MscO88940 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MscO88940 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MscO88940 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MscO88940 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MscO88940 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MscO88940 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MscO88940 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MscO88940 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MscO88940 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MscO88940 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MscO88940 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MscO88940 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MscO88940 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MscO88940 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MscO88940 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MscO88940 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms