Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Apaf1O88879 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Apaf1O88879 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms